Metódu čistenia PCB je potrebné vhodne zvoliť na základe typu kontaminácie a scenára použitia; jedno{0}}veľkosť-vyhovuje-všetkým prístup nie je možný. Pri bežnom čistení po výrobe alebo oprave je najbežnejšou metódou utieranie bezvodým alkoholom alebo špecializovanými čistiacimi prostriedkami na elektroniku. Tieto rozpúšťadlá sa rýchlo odparujú a zanechávajú malé zvyšky, vďaka čomu sú vhodné na odstraňovanie zvyškov taviva, ľahkých olejových škvŕn a prachu. Počas prevádzky sa zvyčajne používa handrička, ktorá nepúšťa vlákna, alebo mäkká kefka na jemné utieranie v smere vedenia obvodu, aby sa zabránilo nadmernej sile, ktorá by mohla uvoľniť komponenty alebo poškodiť spájkované spoje. V oblastiach so silnou lokalizovanou kontamináciou možno použiť metódu čistenia z bodu do bodu{8}}po{9}}, ktorá problém rieši postupne, namiesto opakovaného utierania veľkých plôch.
Ak sú na doske plošných spojov odolné kontaminanty, ako sú nánosy kolofónie, priemyselné olejové škvrny alebo zvyšky vytvorené dlhodobou -oxidáciou, možno zvážiť čistenie ultrazvukom. Táto metóda zahŕňa ponorenie dosky plošných spojov do špecializovaného čistiaceho roztoku, kde kavitačný efekt generovaný vysoko-vibráciami uvoľňuje nečistoty z malých štrbín, čo vedie k dôkladnejšiemu čisteniu než pri manuálnych metódach. Je však dôležité kontrolovať čas čistenia a zloženie kvapaliny, aby ste predišli poškodeniu citlivých komponentov (ako sú konektory, relé a mikrofóny). Po vyčistení je nevyhnutné dôkladné vysušenie; v opačnom prípade môže zvyšková vlhkosť spôsobiť skrat alebo koróziu.
